Vectorologie

La Plateforme apporte son expertise aux équipes souhaitant démarrer et / ou utiliser des productions de vecteurs lentiviraux.

Image fournie par Lela Maffie de Pixabay

La Plateforme Vectorologie (Site Paris Rive Gauche) est localisée sur le campus des Grands Moulins dans le bâtiment Lamarck B. Elle est ouverte aux équipes internes à l’Université Paris Cité mais également aux autres équipes de recherche académiques et industrielles.
Elle offre un savoir-faire technologique dans le domaine de la production de vecteurs lentiviraux destinés au transfert stable.

Ce système de transfert est utilisé dans de nombreux domaines qui vont de la recherche fondamentale à la clinique.
Les applications sont multiples :
– La surexpression de gènes ou l’expression ectopique de gènes
– Le knock-down de gènes par des vecteurs véhiculant des shRNAs
– L’expression ou la répression régulée de gènes par des vecteurs lentiviraux inductibles
– L’édition du génome (CRISPR/Cas9)

Expertises

La Plateforme apporte son expertise au service des équipes de recherche en proposant des formations individualisées concernant l’apprentissage du travail en zone confinée L3 et la production des vecteurs lentiviraux.

Elle peut également accompagner les équipes dans l’utilisation du système d’édition du génome CRISPR/Cas dans un contexte viral (en collaboration avec le Plateau GENIE également situé au sein de l’UMR 7216).

Elle met son savoir-faire en terme d’Hygiène et Sécurité au service des équipes de recherche (déclaration OGMs, élimination des déchets,…).

Équipements

Au sein de la Plateforme, un laboratoire de type L3 est accessible pour toute les équipes qui voudraient faire leurs propres vecteurs viraux pour un projet donné.

C’est une salle de culture avec toutes les accréditations légales pour produire et utiliser les microorganismes OGM de classe 2 et 3.

A l’intérieur, les équipements suivants sont mis à disposition:

– 2 Postes de Sécurité Microbiologique de type II

– 2 incubateurs à CO2 pour la culture de cellules

– une centrifugeuse “de paillasse”

– une ultracentrifugeuse avec rotors swing-out (6x36mL, 6x15mL)

– un microscope inversé à fluorescence équipé d’une caméra

Services proposés

La Plateforme Vectorologie donne la possibilité de produire et/ou manipuler des vecteurs viraux au sein du laboratoire L3 mis à disposition.

Elle accompagne les équipes sur le choix des vecteurs et les stratégies de clonage.

Elle propose un accompagnement complet des nouveaux utilisateurs en les formant individuellement et les conseillant sur la production et l’utilisation de vecteurs lentiviraux.

Elle peut également s’occuper de la déclaration OGM indispensable à la préparation des vecteurs lentiviraux.

La Plateforme Vectorologie ayant sous sa responsabilité le seul laboratoire L3 du campus, elle permet également de manipuler tout type de pathogènes de classe 3 après accord du comité de pilotage.

2 niveaux d’accès:

– l’accès au L3 et à ses équipements.

– l’accès au L3 avec une formation, dispensée par le personnel de la Plateforme, sur la production et l’utilisation de vecteurs lentiviraux .

Télécharger le dossier de demande d’accès à la Plateforme Vectorologie. A envoyer à : ekaterina.boyarchuk@u-paris.fr

Comité de pilotage

Il est jumelé avec celui du plateau GENIE.

Slimane Ait-Si-Ali
Pierre Antoine Defossez
Aurélie De Thonel
Responsable plateforme Vectorologie et plateau GENIE (Ekaterina Boyarchuk)

Publications

2024

• Richard A., Berthelet J., Judith D., Advedissian T., Espadas J., Jannot G., Amo A., Loew D.,Lombard B., Casanova AG., Reynoird N.,Roux A., Berlioz-Torrent C., Echard A., Weitzman J B. & Medjkane S. Methylation of ESCRT-III components regulates the timing of cytokinetic abscission. Nature Communications 2024 May

2023

• Yakhou L, Azogui A, Gupta N, Richard Albert J, Miura F, Ferry L, Yamaguchi K, Battault S, Therizols P, Bonhomme F, Bethuel E, Sarkar A, Greenberg MVC, Arimondo PB, Cristofari G, Kirsh O, Ito T, Defossez PA0 A genetic screen identifies BEND3 as a regulator of bivalent gene expression and global DNA methylation. Nucleic Acids Res. 2023 Oct

• Gupta N, Yakhou L, Albert JR, Azogui A, Ferry L, Kirsh O, Miura F, Battault S, Yamaguchi K, Laisné M, Domrane C, Bonhomme F, Sarkar A, Delagrange M, Ducos B, Cristofari G, Ito T, Greenberg MVC, Defossez PA. A genome-wide screen reveals new regulators of the 2-cell-like cell state Nat Struct Mol Biol. 2023 Aug

• Rosspopoff O, Cazottes E, Huret C, Loda A, Collier A, Casanova M, Rugg-Gunn P, Heard E, Ouimette, J-F, Rougeulle C. Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs . Nucleic Acids Research, 2023 Feb

2019

• Casanova M, Moscatelli M, Chauvière LÉ, Huret C, Samson J, Liyakat Ali TM, Rosspopoff O, Rougeulle C. A primate-specific retroviral enhancer wires the XACT lncRNA into the core pluripotency network in humans. Nat Commun. 2019 Dec 11;10(1):5652.

• Codato R, Perichon M, Divol A, Fung E, Sotiropoulos A, Bigot A, Weitzman JB, Medjkane S.The SMYD3 methyltransferase promotes myogenesis by activating the myogenin regulatory network. Sci Rep. 2019 Nov 21

• Naciri I, Laisné M, Ferry L, Bourmaud M, Gupta N, Di Carlo S, Huna A, Martin N, Peduto L, Bernard D, Kirsh O, Defossez PA. Genetic screens reveal mechanisms for the transcriptional regulation of tissue-specific genes in normal cells and tumors. Nucleic Acids Research, 07 February 2019 gkz080, https://doi.org/10.1093/nar/gkz080

2018

• Furlan G, Gutierrez Hernandez N, Huret C, Galupa R, van Bemmel JG, Romito A, Heard E, Morey C, Rougeulle C. The Ftx Noncoding Locus Controls X Chromosome Inactivation Independently of Its RNA Products. Mol Cell. 2018 Apr 20. pii: S1097-2765(18)30227-2.