Équipements

La majorité des équipements de la plateforme sont accessible après formation, toutefois certains sont utilisables uniquement par l‘intermédiaire du personnel de la plateforme.

Quantification et contrôle qualité

Spectrophotomètre à UV et fluoromètre – DS11-FX – DeNovix

• Contrôle qualité et quantification des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
• Accès libre

Fluoromètre – QuBit 2.0 – Life Technologies

• Quantification des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
• Accès libre

Electrophorèse capillaire – Bioanalyzer 2100 – Agilent

• Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Electrophorèse capillaire – TapeStation 2200 – Agilent

• Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Préparation des échantillons

Robot pipetteur – EVO 100 – Tecan

• Préparation de plaques qPCR 384 et 96 puits de façon automatisée.
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Sonicateur – Bioruptor Pico – Diagenode

• Sonication d’ADN génomique et de chromatine sous température contrôlée.
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

QIAcube – Qiagen

• Préparation automatisée de colonnes de purification Qiagen.
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Système automatisé – IP-Star – Diagenode

• Automatisation de protocole d’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), de l’ADN méthylé (MeDIP) ou hydroxyméthylé (hMeDIP), préparation de librairies pour NGS.
• Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

Système automatisé – KingFisher APEX – ThermoFisher 

• Automatisation de protocole d’extraction d’ADN ou d’ARN, d’immunoprécipitation de protéine et de chromatine (ChIP).
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Analyse

Machine PCR quantitative – Viia7 – Applied Biosystems

• Système de PCR quantitative, blocs 384 et 96 puits.
• Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Machine PCR quantitative – QuantSudio 6 Pro – Applied Biosystems

• Système de PCR quantitative, blocs 384 et 96 puits.
• Accès libre sur réservation après formation.

Machine PCR quantitative – 7500 Fast – Applied Biosystems

• Système de PCR quantitative, bloc 96 puits.
• Accès libre sur réservation après formation.

Machine PCR quantitative – LightCycler 480 II – Roche

• Système de PCR quantitative, blocs 384 et 96 puits.
• Accès libre sur réservation après formation.

Pyroséquenceur – PyroMark Q24 Advanced – Qiagen

• Séquençage rapide pour l’analyse de la méthylation de l’ADN et de mutations (SNPs, insertions-délétions, génotypage).
• Accès libre sur réservation après formation.

Pyroséquenceur – PyroMark Q48 Autoprep – Qiagen

• Séquençage rapide pour l’analyse de la méthylation de l’ADN et de mutations (SNPs, insertions-délétions, génotypage).
• Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

MinION – Oxford Nanopore Technology

• Séquençage en temps réel de long fragments d’ADN et d’ARN et analyse possible de base modifiée.
• Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.