Équipements

La majorité des équipements de la plateforme sont accessible après formation, toutefois certains sont utilisables uniquement par l‘intermédiaire du personnel de la plateforme.

Les équipements de la plateforme

Ils permettent la quantification, le contrôle qualité, la préparation et l’analyse d’échantillons d’ADN et d’ARN.

© Laure Ferry

Quantification et contrôle qualité

Spectrophotomètre à UV et fluoromètre – DS11-FX – DeNovix

  • Contrôle qualité et quantification des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès libre

Fluoromètre – QuBit 2.0 – Life Technologies

  • Quantification des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès libre

Electrophorèse capillaire – Bioanalyzer 2100 – Agilent

  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Electrophorèse capillaire – TapeStation 2200 – Agilent

  • Contrôle qualité des échantillons d’ADN et d’ARN rapide et dans un petit volume.
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Préparation des échantillons

Robot pipetteur – EVO 100 – Tecan

  • Préparation de plaques qPCR 384 et 96 puits de façon automatisée.
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Sonicateur – Bioruptor Pico – Diagenode

  • Sonication d’ADN génomique et de chromatine sous température contrôlée.
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

QIAcube – Qiagen

  • Préparation automatisée de colonnes de purification Qiagen.
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Système automatisé – IP-Star – Diagenode

  • Automatisation de protocole d’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), de l’ADN méthylé (MeDIP) ou hydroxyméthylé (hMeDIP), préparation de librairies pour NGS.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

Système automatisé – KingFisher APEX – ThermoFisher 

  • Automatisation de protocole d’extraction d’ADN ou d’ARN, d’immunoprécipitation de protéine et de chromatine (ChIP).
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Analyse

Machine PCR quantitative – Viia7 – Applied Biosystems

  • Système de PCR quantitative, blocs 384 et 96 puits.
  • Accès libre sur réservation après formation. Les consommables sont à la charge des utilisateurs.

Machine PCR quantitative – QuantSudio 6 Pro – Applied Biosystems

  • Système de PCR quantitative, blocs 384 et 96 puits.
  • Accès libre sur réservation après formation.

Machine PCR quantitative – 7500 Fast – Applied Biosystems

  • Système de PCR quantitative, bloc 96 puits.
  • Accès libre sur réservation après formation.

Machine PCR quantitative – LightCycler 480 II – Roche

  • Système de PCR quantitative, blocs 384 et 96 puits.
  • Accès libre sur réservation après formation.

Pyroséquenceur – PyroMark Q24 Advanced – Qiagen

  • Séquençage rapide pour l’analyse de la méthylation de l’ADN et de mutations (SNPs, insertions-délétions, génotypage).
  • Accès libre sur réservation après formation.

Pyroséquenceur – PyroMark Q48 Autoprep – Qiagen

  • Séquençage rapide pour l’analyse de la méthylation de l’ADN et de mutations (SNPs, insertions-délétions, génotypage).
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

MinION – Oxford Nanopore Technology

  • Séquençage en temps réel de long fragments d’ADN et d’ARN et analyse possible de base modifiée.
  • Accès : uniquement par l’intermédiaire du personnel de la plateforme.

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